当公司公章丢失时，可按以下步骤进行处理。
首先，要进行登报挂失。这是为了向社会公众声明公章已经丢失，自登报之日起，他人再使用该公章进行的任何行为，公司原则上不承担责任。这一步骤虽然在法律上没有强制要求，但在实际操作中是一种常见且有效的自我保护措施。
然后，需要向公安机关报案。依据《中华人民共和国治安管理处罚法》第五十二条规定，伪造、变造或者买卖国家机关、人民团体、企业、事业单位或者其他组织的公文、证件、证明文件、印章的，处十日以上十五日以下拘留，可以并处一千元以下罚款；情节较轻的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款。向公安机关报案能让他们介入调查，防止有人利用丢失的公章从事违法犯罪活动，同时也能获得报案证明，这是后续补办公章的重要材料。
最后，进行公章的补办。公司需携带营业执照副本原件及复印件、法定代表人身份证原件及复印件、法定代表人签署的公章遗失说明、公安机关的报案回执等材料，到公安机关指定的刻章单位办理新公章的刻制手续。刻制完成后，还需要到相关部门进行备案，以确保新公章的使用合法合规。